水洗法：光泽好，混入异物少，酸味稍好些，哥伦比亚，墨西哥，危地马拉采用此法。缺点：时间处理不好会产生臭味和特殊的酸味。

被摘取下来的咖啡樱桃包括有刚好成熟的，或是过度成熟的，还有尚未成熟的，全都混合在一起。如果不把这些咖啡樱桃加以分开处理的话，所得到的咖啡豆的品质实在不堪入口，因为其中夹杂着许多味道很差的杂质。所以这些咖啡樱桃就要先被洗干净，放在满水的大槽之中准备做初步的分类。最好的咖啡的密度都比较高，所以会沉入水中。而过度成熟的咖啡樱桃则会浮出水面，很容易就将之分类了。先将咖啡樱桃外层的果肉除去，然后浸泡在一个很大的盛满水的水槽内。经过发酵处理之后，水洗式咖啡会有一种特有的鲜明清澈的风味。发酵过后的咖啡豆再以清水洗过，然后排除水份再放在阳光下晒干或是用机器干燥。最后用脱壳机将肉果皮和银皮除去，即可进行筛选并分成不同等级的生咖啡豆。