一般而言，阿拉比卡豆含约1.3%的咖啡因，而罗布斯塔豆则更高2至3倍。要做出低因的咖啡豆，现今多靠化学溶剂、水处理及二氧化碳这三种技术，不过大部分咖啡豆都还没能够做到零咖啡因，始终会有不多于0.3%的残余咖啡因在内。

口味上亦有一定的分别，因为低因咖啡豆是要在烘焙前先处理，提取出带来芳香口味的咖啡因，因此，有人会认为味道变淡。但是低因咖啡也有其独特的口味，一样具芬香、柔和、微酸等不同层次。像印尼咖啡和肯尼亚咖啡，本身在风味上也是截然不同，只要烘焙得宜和新鲜，同样是美味可口的咖啡。不过，低因咖啡豆可供选择的产地不多，普遍只有巴西及哥伦比亚两款。由于容易氧化变质，低因咖啡保存期较一般的咖啡为短，最好在一星期内享用，未经低因处理的咖啡最佳享用期限由烘焙日开始计的一至三个月。