加拉帕戈斯群岛是由火山喷发而形成的，岛上耸立着一座座高大的火山，最高的在群岛中面积最大的伊莎贝拉岛（伊莎贝尔）上，名为沃尔夫火山（1707米），次高的是一座死火山，亦在该岛上，名为阿苏尔山（1689米）。一些火山口形成的天然湖泊犹如镶嵌在火山顶峰的碧玉，晶莹闪亮。崎岖不平的地表堆满了暗红色的火山喷发物。这个群岛虽然距赤道不远，但由于受秘鲁寒流的影响，这里不适于终年高温多雨、植物繁茂的热带雨林的生长，只有一些仙人掌和灌木丛分布在其沿海地区；高大的树木生长在较高的山坡，树下铺满羊齿类植物。这里受秘鲁寒流的影响，虽地处赤道附近，但并非终年高温多雨。这样的环境适合热带和寒带动物共同生存。你可以在这里看到多种类型的动物：海狮、海豹、海獭、鹈鹕、信天翁、企鹅、反舌鸟、火烈鸟等。

毫无疑问，给达尔文灵感的就是加拉帕戈斯的成群结队的雀科鸣鸟。所有这些鸟都是偶然从南美洲飞抵这里的古老品系的后代。它们在整个岛上找到了许多闲置的适于栖息的生态环境，并进化成能在体形大小、鸟喙形状、羽毛颜色、声音、饮食和行为等方面各有不同的13个品种。不同品种的鸟，其嘴部的差异性就是这种适应性传播的最好证明。有些鸟具有典型的食籽喙，另一些以仙人掌植物为食的鸟长有一种长而尖的嘴，还有一些以昆虫为主食的鸟拥有一个小乳头状的鸟喙。啄木鸟不仅长有一个专门的喙，而且还形成一种复杂的行为模式，包括用仙人掌刺去捕获裂缝中的幼虫。

最著名的动物有巨型海龟（又称“象龟”），它们的数量成千上万，身长多在1米以上，成熟的龟体体重约180千克，最重的体重可达250千克，寿命最长的可达400年。这里的巨龟，即便是同一种类，因其生存岛屿的不同，甲壳的形状各有差异。

这里还因为生存着闻名遐尔的史前爬虫类动物鬣蜥（亦称“海鬣蜥”）而引起全世界的关注。这些鬣蜥能潜入海水中捕捉食物，而雌鬣蜥必须经长途跋涉到火山口产卵。这种鬣蜥仅以海草为食，7种不同的海鬣蜥，每种都显示明显的差异，并在不同的岛屿上进化。6个岛屿上均有一种为加拉帕戈斯群岛特有的陆生鬣蜥。这种地球上惟一尚存的海鬣蜥可以在海底爬行，它们以海草为食，并且通过发育不完全的蹼足适应了海上生活方式。