布隆迪境内有两大主要民族，为数约只有一成半的图西人（Tutsi）自16世纪以来就一直拥有该国的统治权，控制着主要是由胡图人（Hutu）组成的平民百姓，再加上非常稀少的原住民特瓦人（Twa）。这种少数民族占高位的不正常社会结构埋下国家不稳定的恶种，并且在1993年10月时到达最高峰。那时刚上任才四个月、布隆迪有史以来第一位胡图人身份的元首，也是首任民选总统的梅尔希奥·恩达达耶（Melchior Ndadaye），遭到主要是图西人控制的军方暗杀。恩达达雅的死，导致全面性的种族冲突，在这场种族冲突中至少有二十万的双方人口遭到屠杀，而当中原来有人口6.5万的图西人被屠杀至剩下5000人不到。这场屠杀一直持续到2002年时主政的图西政府终于在国际的斡旋下与四支不同的胡图叛军签下停战协议，而与最后一支反政府武装组织民族解放力量（法语：Conseil National Pour la Défense de la Démocratie–Forces pour la Défense de la Démocratie，NCDD–FDD）的停火协议，则是在2006年9月7日时于坦桑尼亚首都达累斯萨拉姆签署。[4]
