德国化学家弗里德里奇·费迪南·龙格是第一个分离出咖啡因并说明其不良影响的人，从那时起，咖啡因就引起了咖啡饮用者、医生和科学家们的担心。然而，最初研究的重点是关于饮用过量咖啡因对健康的不利影响，几乎没有对摄入适量咖啡(不是单纯的咖啡因)给健康带来的积极影响进行评估。1819年，年轻的龙格开始进行化学实验，并发现了颠茄提炼物对眼睛的影响。1820年，龙格把他的发现告诉给他的好朋友歌德，歌德鼓励他对咖啡进行分析。几个月后，龙格首次提炼出了咖啡因。乔安·沃尔夫冈·歌德是德国诗人、小说家、人道主义者、理论家、画家和政治家，酷爱喝咖啡。歌德的影响遍及欧洲，在之后的整整一个世纪中，他的作品是音乐、戏剧、诗歌和哲学的主要灵感源泉。因为歌德的鼓励，咖啡因才得以被人类发现。

　　咖啡因是食品中被研究得最彻底的成分。咖啡因对人体健康影响的研究已经很充分。现代科学几乎知道咖啡因的所有优缺点，但是咖啡与人类健康的关系却知之甚少。过去的研究认为，咖啡对人体健康非常有害，因为它含有咖啡因。几乎在发表过的每一篇有关咖啡的科技文章中，焦点都是咖啡因含量和提纯咖啡因对人或动物的影响。咖啡因被认为是咖啡里主要的精神刺激成分，但事实并不是这样。今天，每个有学识的医生、科学家、咖啡饮用者都可以完全肯定摄入适量咖啡因(最多500毫克)是安全的，相当于3-4杯咖啡中的含量。每天摄入500-600毫克则会有一定的健康风险。1987年，美国食品和药物管理局(FDA)重新确认了它的积极作用。科学试验表明，碳酸饮料里的咖啡因对人体没有任何副作用。美国国家科学院、科学研究理事会和外科医生办公厅报道，摄入适量咖啡因与增加健康危险性之间无相关性。经常喝咖啡的人突然停止摄取咖啡因可引起轻微的戒断症状(例如困倦或偶尔头痛)，但不会出现上瘾行为。咖啡因柠檬酸盐作药用时的剂量是20毫克/千克，用于治疗早产儿窒息。咖啡因也用于缓解脊髓穿刺后头痛和偏头痛。