在19世纪进入肯尼亚，当时埃塞俄比亚的咖啡饮品经由南也门进口到肯尼亚。但直到20世纪初，波旁咖啡树才由圣．奥斯汀使团(St．AustinMission)引入。

肯尼亚咖啡大多生长在海拔1500--2100米的地方，一年中收获两次。为确保只有成熟的浆果被采摘，人们必须在林间巡回检查，来回大约7次。肯尼亚咖啡由小耕农种植，他们收获咖啡后，先把鲜咖啡豆送到合作清洗站，由清洗站将洗过晒干的咖啡以“羊皮纸咖啡豆”(即外覆内果皮的咖啡豆)的状态送到合作社(“羊皮纸咖啡豆”是咖啡豆去皮前的最后状态)。所有的咖啡都收集在一起，种植者根据其实际的质量按平均价格要价。这种买卖方法总体上运行良好，对种植者及消费者都公平。

肯尼亚政府极其认真地对待咖啡业，在这里，砍伐或毁环咖啡树是非法的。肯尼亚咖啡的购买者均是世界级的优质咖啡购买商，也没有任何国家能像肯尼亚这样连续地种植、生产和销售咖啡。所有咖啡豆首先由肯尼亚咖啡委员会(CoffeeBoardofKenya，简称CBK)收购，在此进行鉴定、评级，然后在每周的拍卖会上出售，拍卖时不再分等。肯尼亚咖啡委员会只起代理作用，收集咖啡样品，将样品分发给购买商，以便于他们判定价格和质量。 内罗毕(Nairobi)拍卖会是为私人出口商举行的，肯尼亚咖啡委员会付给种植者低于市场价的价格。最好的咖啡等级是豆形浆果咖啡(PB)，然后是AA++、AA+、AA、AB等等，依次排列。上等咖啡光泽鲜亮、味美可口且略带酒香。组织拍卖也是为了满足调配商的需求。这种拍卖会通常拍卖量较小(每宗3-6吨)，有附有种植者标志的样品以供买家品赏。拍卖后，出口商按不同风味、不同质量及调配商所需的数量包装。这为调配商提供了极大的灵活性。注重质量的德国人和北欧人是肯尼亚咖啡的长期购买商。

就国际范围而言，肯尼亚咖啡的增长数量是显而易见的，1969--1970年，出口80万袋，到1985－1986年，出品量增至200万袋。一般产量稳定在160万袋，平均每公顷产量约为650公斤。咖啡价格突涨之前，肯尼亚咖啡的平均价格就一直在上升。1993--1994年的价格比12个月前抬高50%。价格上涨主要是需求增加的结果肯尼亚北邻阿拉比卡咖啡树的原产地衣索匹亚，但迟至二十世纪初交，才开始从事咖啡栽培业，十九世纪传教士从叶门引进阿拉比卡树，但未大量栽种，直到一八九三年，又引进巴西古老的波旁咖啡种籽，才大规模栽培咖啡，也就是说，肯尼亚咖啡带有巴西血统，由于水士、气候和处理方式回异，肯尼亚豆风味和巴西豆截然不同。 巴西咖啡的栽种海拔低，质地较软，果酸味不明显。反观肯尼亚咖啡树主要集中在肯尼亚山附近的坡地，海拔约四千英尺至六千五百英尺，此高度适合咖啡豆发展风味，因为山区温度较低，成长较慢，咖啡豆的芳香成分得到充分发展，果酸味更为明显，质地也较硬。另外，肯尼亚早期是英国殖民地，英国人已建立一套完善的栽培、品管制度。肯尼亚独立后，咖啡业在既有基础上。

肯尼亚的咖啡农庄有两个类型，一种是占地五英亩以上的大型栽植场，不过海拔平均较低，就肯尼亚咖啡而言，大农庄的咖啡豆品质只能算中等。极品肯尼亚豆则产自小型农庄，多半位于五、六千英尺以上的山麓或火山坡地，每户小农每季产能只有二十至七十袋左右，无力投资昂贵的水洗处理厂，但小农很团结，集合数百户或数千户成立合作农场，由政府出资兴建水洗处理厂，小农采摘的咖啡果子就送往合作农场，统一加工，先剔除半生不熟或烂掉的果子，再进行去皮、发酵、分解果肉，取出咖啡豆，再干燥和磨光，整个过程由官方的咖啡管理局督导，相当严谨，确保了肯尼亚咖啡的品质。肯尼亚豆的水洗加工技术及高标准品管，一直是产豆国表率