2006年1月1日期实行新的行政区划。卢旺达全国划分为4个省(卢旺达语:intara)东部省(Province de l'Est)、北部省(Province du Nord)、西部省(Province de l'Ouest)、南部省(Province du Sud)基加利市(Ville de Kigali)和1个市(基加利市),下设40个县市(akarere)、416个乡镇(umujyi)卢旺达属温带和热带高原气候,由于海拔较高,其气温比典型的赤道国家要低。位于该国中部的基加利日常温度一般在12至27°C之间,全年波动幅度较小。全国范围内也有一些地方温差较大,多山的西部和北部比东部低洼地区的气温要低。卢旺达每年有两个雨季,每一个从2月持续到6月,第二个从9月到10月;同时也有两个旱季,其中6到9月这个持续时间较长,经常完全没有降水,另一个则是从12月持续到次年2月,相对来说情况不及前一个那么严重。降雨量因地域而不同,每年西部和西北部降水较东部和东南部为多。不过,雨季模式已因气候变化而出现变动。战略前瞻组织的一份报告中称,每年阴雨天数有时会变少,但短时间内的降雨量更大。还有些情况下单一天内就会频繁出现倾盆大雨,降雨量超过以往一个月的总和。此外还存在雨季姗姗来迟或是提早结束的情况