15世纪，葡萄牙、西班牙和英国先后侵入。1596年荷兰侵入，1602年成立具有政府职权的“东印度公司”，1799年底改设殖民政府。

1942年日本占领印尼，1945年日本投降后，印尼爆发八月革命，1945年8月17日宣布独立，成立印度尼西亚共和国。

印度尼西亚独立后，先后武装抵抗英国、荷兰的入侵，发动了三次独立战争。1947年后，荷兰与印尼经过多次战争和协商，于1949年11月签订印荷《圆桌会议协定》。根据此协定，印尼于同年12月27日成立联邦共和国，参加荷印联邦。

1950年8月印尼联邦议院通过临时宪法，正式宣布成立印度尼西亚共和国，同一年印尼成为联合国第60个成员国。1954年8月脱离荷印联邦。

1967年，印尼与马来西亚、菲律宾、新加坡和泰国成立了 “东南亚国家联盟”（ASEAN，简称“东盟”），东盟已经拥有10个成员国，印尼是最具影响力的成员之一。[6] 

1997年亚洲金融危机对印尼造成全面冲击，引起局势动荡。

1998年5月，执政长达32年的苏哈托总统辞职，副总统哈比比接任总统。1999年10月，印尼人民协商会议（简称人协）选举瓦希德为总统，梅加瓦蒂为副总统。2001年7月23日，人协特别会议以渎职罪罢免瓦希德总统职务，梅加瓦蒂接任总统，哈姆扎·哈兹任副总统。

2004年7月，印尼举行历史上首次总统直选，原政治安全统筹部长苏西洛和人民福利统筹部长尤素夫·卡拉（Muhammad Jusuf Kalla）通过两轮直选胜出，2004年10月20日宣誓就任总统和副总统。

2005年8月，印尼政府与“亚齐独立运动”分离组织达成和平协议。2006年7月，印尼国会通过亚齐管理法。2006年12月，亚齐举行地方选举，前“亚独运动”领导人伊尔万迪·尤素夫（Irwandi Yusuf）和穆罕默德·纳扎尔（Muhammad Nazar）当选省长和副省长。2012年4月，前“亚齐独立军”领导人宰尼·阿卜杜拉（Zaini Abdullah）和穆扎基尔·马纳夫（Muzakir Manaf）当选省长和副省长，任期至2017年
爪哇咖啡豆早年的爪哇咖啡盛名远播，这里指的是以前爪哇岛出产的阿拉比卡咖啡。它有一种浓郁的芳香，酸度较低，口感润滑，与摩卡咖啡拼配在一起，所造就的“爪哇摩卡综合咖啡”曾经风靡一时，成为顶级咖啡的代名词，声名远播。

　　那时，销往欧洲的爪哇咖啡是一种非常特别的咖啡。由于当时是以帆船运抵欧美诸国的，路途遥远再加上航速慢，所以在运送路途上要耗费大量时间。咖啡在这样的情况下，好似经过了一种特殊的发酵，味道非常独特。

　　后来当轮船取代帆船后，由于运送时间缩短，人们喝到的是比较新鲜的咖啡豆。但喝惯了陈豆的人们不习惯这种新鲜口味，所以拼命追求陈年爪哇咖啡，以至于印尼政府和一些商人故意把新鲜豆在仓库里存放一到两年，再卖给消费者。事实上，与新鲜豆相比，陈年爪哇豆酸度降低到接近于零，而香味却更加浓郁。因为储藏的时间较长，成本增加不少，数量有限，所以陈年爪哇一直是咖啡市场上的抢手货。19世纪80年代，有0商故意在一些新鲜的危地马拉或委内瑞拉豆上做手脚，仿制陈年爪哇高价出售。不可容忍的是，0商们以染色的方式来让咖啡豆看起来更像陈年爪哇，但毫无疑问，染色的化学物质当然是有毒的。

　　爪哇只生产少量的阿拉比卡豆，而大部分是锈蚀病灾难后从非洲引进的罗姆斯达豆。这种咖啡烘焙后苦味强烈但香味极其清淡，虽然酸度较低，口感也比较细腻，但很少被用来直接饮用，常被用来拼配综合咖啡，或用于制造速溶咖啡