公元一九八零年，美国食品及药物管理局( FDA)曾发表声明，建议己经怀孕或可能怀孕的妇女减少咖啡因的摄取;但是之后的许多研究结果均表示，没有证据可以显示适量的咖啡因会对胎儿造成不利的影响，也没有医学报告禁止孕妇喝咖啡，但是FDA并没有改变原先的忠告，因为孕妇在怀孕的第二和第三期，代谢咖啡因的速度大约会比未怀孕时快两倍，而且，咖啡因还会越过胎盘进入胎儿，亦会透过母乳的哺育流入婴儿体内，因此建议孕妇和产妇对咖啡因的摄取愈谨慎愈好。

　　近年来由于医学保健的宣导，许多人开始注意钙质流失和骨质疏松的问题，至于咖啡因的摄取和骨质疏松症的关系，仍在持续研究中，目前并没有直接证据显示咖啡因会导致骨质疏松症，但是某些研究则指出咖啡因会增加钙质的排泄，所以目前的建议是咖啡的爱好族应该多吃些含高钙的食品来补充钙质，如果能在喝咖啡前先喝牛奶，也可以让体内原先的钙质流失得较少。