咖啡豆是咖啡樱桃的核果由外到内去除后，才会得到咖啡豆。不同的咖啡豆处理方法会影响到咖啡豆的风味。

最传统的处理法是日晒处理法，较多雨的地区或更在意品种的产量的通常使用水洗。介于日晒和水洗中间的新环保处理法是半水洗。

日晒处理法就是把咖啡樱桃拿去晒太阳，大概一周后会晒成深色。这时候就很容易把晒乾的果皮、果肉、果胶除掉，最后再把瑕疵豆挑出来。它的优点就是低成本，曝晒太阳这个过程使得咖啡豆有较高的果香味、甜味，酸味比较少。缺点是日晒处理法需要太阳和大的场地，经常下雨的地方就会改用水洗处理法。

水洗处理法是在水槽里把咖啡樱桃中的杂质去除，接着用去除机去除果皮和果肉。弄后再用水洗一遍，拿去晒干，晒干后用去壳机把内果皮打掉。最后一样是把瑕疵豆挑出来。水洗豆整齐美观，咖啡品质最高，是精品咖啡常用的处理法。它的优点是受气候影响小，经过水洗处理的豆子风味干净无杂质，保留了更多酸香味。缺点是要耗费大量的水。

半水洗和水洗一样用水去除咖啡樱桃中的杂质，投入筛出机去除果皮果肉。然后再用果胶刮除机，加入少量的水去除果胶，最后再日晒晒干。优点是能够节约用水，缺点是过程比较繁琐。