有时发酵时间处理不好会产生发酵臭和特殊的酸味;处理得好，可形成咖啡豆个性化的香味。这时的咖啡豆，已可装入麻袋送到各地，或装入特殊的集装箱漂洋过海了。

成熟的咖啡浆果外型像樱桃，呈鲜红色，果肉甜甜的，内含一对种子，也就是咖啡豆（Coffee Beans）。咖啡品种有小粒种、中粒种和大粒种之分，前者含咖啡因成分低，香味浓，后两者咖啡因含量高，但香味差一些。世界销售的咖啡一般是由小粒种和中粒种按不同的比例配制而成，通常是七成中粒种，主要取其咖啡因；三成小粒种，主要取其香味。每个咖啡品种一般都有几个到十几个变异种。咖啡比较耐阴耐寒，但不耐光、不耐旱、不耐病。咖啡含有咖啡碱、蛋白质、粗脂肪、粗纤维和蔗糖等九种营养成分，作为饮料，它不仅醇香可口，略苦回甜，而且有兴奋神经、驱除疲劳等作用。在医学上，咖啡碱可用来作麻醉剂、兴奋剂、利尿剂和强心剂以及帮助消化，促进新陈代谢。咖啡的果肉富含糖份，可以制糖和制酒精。咖啡花含有香精油，可提取高级香料