在水洗过程中，果实的果皮和果肉经特殊的去浆机处理与咖啡豆剥离。咖啡豆随后进入发酵缸进行发酵处理，以使粘膜不再粘滑。黏膜中的糖分会在发酵过程中被分解。根据发酵手法的不同，发酵的时间通常为12小时至6天(一些种植者会利用淋水系统发酵咖啡豆。这种方法被称为“肯尼亚水洗法(Kenyan method)，通常会持续数日)。决定何时停止发酵极为重要。一旦咖啡过度发酵，咖啡的味道就会变得过酸。一旦粘膜的粘性物质被分解殆尽，人们就会利用大量的水将其冲洗下去(生豆处理过程中产生的废水被认为是咖啡工业的污染源头。如今，很多地区正在研究先进技术，以回收利用并过滤这一过程产生的废水)。水洗发产生于19世纪，也被称为“湿法加工”。水洗法：利用水洗和发酵的方法去除果皮果肉及粘膜。这种方法也被称为“完全水洗法(Fully Washed)”。水洗发是世界上大部分咖啡原产国处理阿拉比卡咖啡豆最常见的方法。一些地区还会利用先进的高压水洗机来清洗咖啡豆的果皮果肉及粘膜，因此不再需要发酵处理。这种利用高压水洗机处理咖啡豆的方法被称为“自然水洗法(Pulped Natural)”这种处理方法的过程最为简单。果实在采摘之后不经处理便开始日晒干燥过程。这是现存最古老的处理方法。如今埃塞俄比亚和巴西等地仍在使用这种处理方法。自然日晒法在水资源匮乏的地区最为常见。干燥的过程通常要持续4周左右。处理的方法必须非常严谨，以保证咖啡不失去任何风味。自然日晒法要求当地气候极为干燥。在某些地区，人们会利用烘干机辅助咖啡果实的干燥过程(烘干机的热风能够加速干燥过程，帮助人们控制干燥程度)。

　　自然日晒法能够保留咖啡果实的水果香味。在品尝这种咖啡时，你会发现咖啡富有水果香气，口感更加明亮。在干燥之后，人们会用专门的机器去除表层的外壳。这一过程被称为“干燥去壳(Dry Milling)”