萨尔瓦多的咖啡树为阿拉比卡种，主要有Bourbon及Pacas两个种别，其咖啡有体轻、芳香、纯正、略酸、口味清爽均匀的特色。与危地马拉和哥斯达黎加一样，萨尔瓦多的咖啡依据海拔高度进行等级划分，海拔越高，咖啡越好。依海拔高低分为三个等级，分别为SHG(Strictly High Grown)， SG(High Grown)及SC(Central Standard)等。
萨瓦尔多目前最好的咖啡品牌是匹普（Pipil），这是阿兹别克——玛雅人对咖啡的称呼，它已经取得了美国有机物证明学会（Organic Certified Institute of America）的认可。另一种稀有的咖啡是帕克马拉（Pacamara）咖啡，它是帕卡斯（Pacas）咖啡和马拉戈日皮（Maragogype）咖啡的杂交品种。该咖啡的最佳产地位于萨尔瓦多西部，同与危地马拉边界相近的圣安娜相邻。帕克马拉咖啡颗粒饱满，香味不太浓。
