90年代初,游击战争大大地破坏了该国的国民经济,使咖啡的产量从70年代初的350万袋下降到1990–1991年的250万袋。该国东部受游击战争影响最大,许多农夫和工人被迫离开庄园。资金短缺致使咖啡产量大跌,由过去的每公顷产量1200公斤下降到今天的每公顷产量不足900公斤萨尔瓦多的咖啡是中美洲的特产,该地咖啡体轻、芳香、纯正、略酸。与危地马拉和哥斯达黎加一样,萨尔瓦多的咖啡依据海拔高度进行等级划分,海拔越高,咖啡越好。最好的品牌是匹普(Pipil),这是阿兹别克――玛雅人(AztecMayan)对咖啡的称呼,它已经取得了美国有机物证明学会(Organic Certified Institute of America)的认可。另一种稀有的咖啡是帕克马拉(Pacamara)咖啡,它是帕卡斯(Pacas)咖啡和马拉戈日皮(Maragogype)咖啡的杂交品种。该咖啡的最佳产地位于萨尔瓦多西部,同与危地马拉边界相近的圣安娜(Santa Ana)相邻。帕克马拉咖啡颗粒饱满,当香味不太浓