1942年日本占领印尼，1945年日本投降后，印尼爆发八月革命，1945年8月17日宣布独立，成立印度尼西亚共和国。

印度尼西亚独立后，先后武装抵抗英国、荷兰的入侵，发动了三次独立战争。1947年后，荷兰与印尼经过多次战争和协商，于1949年11月签订印荷《圆桌会议协定》。根据此协定，印尼于同年12月27日成立联邦共和国，参加荷印联邦。

1950年8月印尼联邦议院通过临时宪法，正式宣布成立印度尼西亚共和国，同一年印尼成为联合国第60个成员国。1954年8月脱离荷印联邦。

1967年，印尼与马来西亚、菲律宾、新加坡和泰国成立了 “东南亚国家联盟”（ASEAN，简称“东盟”），东盟已经拥有10个成员国，印尼是最具影响力的成员之一。[6] 

1997年亚洲金融危机对印尼造成全面冲击，引起局势动荡。

1998年5月，执政长达32年的苏哈托总统辞职，副总统哈比比接任总统。1999年10月，印尼人民协商会议（简称人协）选举瓦希德为总统，梅加瓦蒂为副总统。2001年7月23日，人协特别会议以渎职罪罢免瓦希德总统职务，梅加瓦蒂接任总统，哈姆扎·哈兹任副总统。

2004年7月，印尼举行历史上首次总统直选，原政治安全统筹部长苏西洛和人民福利统筹部长尤素夫·卡拉（Muhammad Jusuf Kalla）通过两轮直选胜出，2004年10月20日宣誓就任总统和副总统。

2005年8月，印尼政府与“亚齐独立运动”分离组织达成和平协议。2006年7月，印尼国会通过亚齐管理法。2006年12月，亚齐举行地方选举，前“亚独运动”领导人伊尔万迪·尤素夫（Irwandi Yusuf）和穆罕默德·纳扎尔（Muhammad Nazar）当选省长和副省长。2012年4月，前“亚齐独立军”领导人宰尼·阿卜杜拉（Zaini Abdullah）和穆扎基尔·马纳夫（Muzakir Manaf）当选省长和副省长，任期至2017年

1696年，当时荷兰驻印度Malabar的总督将一批咖啡苗送给荷兰驻巴达维亚batavia（今雅加达Jarkata）的总督，这是印尼首次种植咖啡。不过，这第一批咖啡苗被洪水冲毁。1699年，巴达维亚再次接受馈赠，这一次，咖啡苗顺利成活下来，并在1701年迎来第一次收获，开启了印尼的咖啡之旅。

最初，咖啡种植于雅加达及附近区域，后来，种植区域逐渐扩大到爪哇中部及东部，苏拉威西岛、苏门答腊岛、巴厘岛也开始种植。与此同时，在印尼东部，当时隶属葡萄牙领地的弗洛勒斯岛Flores及帝汶岛Timor也有咖啡种植，只是咖啡苗的源头不同。

1711年印尼咖啡就开始供应欧洲市场，彼时，印尼是非洲及阿拉伯之外，第一个大规模种植咖啡的国家。18世纪80年代成为当时世界最大咖啡出口地。Java咖啡的声名始于此。

印尼咖啡的繁荣的未能持续，18世纪末咖啡生产受到致命打击，最初发现于西爪哇的叶锈病迅速蔓延，摧毁了印尼的阿拉比卡咖啡庄园。咖啡贸易的首领地位被美洲产国取代。不过，值得一提到是，这场叶锈病灾难并没有祸及东部印尼产区，即弗洛勒斯岛和帝汶，现今，帝汶的某些咖啡树，其基因可以追溯到16、17世纪。

根据ICO数据，2013年，印尼咖啡产量居世界第三位，虽然80%都是罗布斯塔咖啡种植方式

荷兰殖民时代，咖啡种植多以大型庄园为主，二战以后，经历过国有化进程及独立运动，如今印尼所产咖啡约90%为小型农户生产。

 

咖啡品种

最初，印尼咖啡为阿拉比卡种，18世纪末的叶锈病灾难摧毁了阿拉比卡庄园，最初，荷兰人尝试种植利比里亚种，后来，开始大规模种植罗布斯塔种。

现在，印尼生产的咖啡中，阿拉比卡种约占10-15%，其余为罗布斯塔，利比里卡种虽有产出，但是基本不在咖啡贸易之列