大家都知道咖啡豆的处理方法不外乎两大类“干法加工湿法加工”此篇博文有详细的介绍从咖啡树到咖啡 接下来我们来看看云南咖啡豆的湿法加工收获之后，人们把浆果或者直接送至果肉采集器(在收获工作做得好的情况下)，或者集中到一个注满了水的虹吸罐中。浆果在这个罐中进行清洗和分离。石头沉到罐底，在罐子排空时以手工的方式捡走。较轻的浆果会漂浮在水面上，与树叶和小树枝一起使用一个笊篱去除。悬浮在水体中的浆果于是用一个虹吸管回收并输送到果肉采集器中。 去除果肉的目的是将果肉从咖啡豆的种皮上分离开。果肉是通过挤压浆果来去除的。由于成熟的浆果含有许多水分，带皮咖啡豆很容易就能在浆果受到挤压时弹出来。下一步是去除粘液，目的是去掉经果肉去除之后紧贴在种皮上的中果皮残留(参见有关咖啡浆果各部分的图示)。由于这种粘液是不溶于水的，且紧紧附着在种皮上，仅靠简单的清洗是无法去除的，因此要么需要将其进行发酵后清洗，要么需要在一种称为粘液清除机的设备中经过强力摩擦才能去除。 在云南，这一工序主要通过自然发酵来完成。发酵这一术语并非100%准确，因为在咖啡豆内部并没有发生生物化学反应。将这一工序称为利用生物化学反应或水解去除粘液更为贴切一些。这一反应是由咖啡浆果中天然存在的酶引起的。

发酵的时间从6小时到72小时不等，这取决于温度、粘液量以及消化酶的浓度等条件。将咖啡置入发酵罐中直到粘液完全被分解就可以对咖啡豆进行清洗了。

保证咖啡质量的关键是要在正确的时间终止发酵，因为发酵过度会导致出现所谓的臭咖啡豆。如果发酵不足或过慢，就会产生丁酸或丙酸，这两种酸都会对咖啡的质量产生不利的影响。

发酵后的带皮咖啡需要在发酵工序完成后立即进行清洗以终止这一工序。但在去除粘液之后以及进行清洗之前可能要用清水将带皮咖啡浸泡12到24小时，以减轻咖啡饮料中的苦涩味道。