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　　咖啡树主要可分为两大品种:阿拉比卡种(coffea arabica)与罗布斯塔种(coffea robusta/coffea canephora)(市场上不多见)。 阿拉比卡(Coffea arabica)种，是最传统的阿拉伯咖啡品种。原产于东非，在西元15世纪以前，咖啡长期被阿拉伯世界所垄断，因此被欧洲人称为“阿拉伯咖啡”。

　　原来世界上的商品咖啡都是小粒咖啡，只是到了19世纪末，发生了一次大面积的病害，种植者才开始寻找其他抗病的品种，目前小粒咖啡仍然是最主要的咖啡品种，约占世界咖啡总产量的3/4。主要在拉丁美洲各国种植，也有部分在印度尼西亚和太平洋岛屿种植。目前世界最大的咖啡产地巴西的地理气候条件非常适合小果咖啡的生长，种植的主要咖啡品种也是小粒咖啡，巴西的咖啡产量占世界总产量的1/3以上。 小粒咖啡的果实比中粒咖啡和大粒咖啡要小，浆果椭圆型，一般内有两粒种子，即所谓的“咖啡豆”。

　　亚种: 小粒种咖啡阿拉比卡种(Coffea arabica)系列中三个出现较早的亚种是∶蓝山亚种(varietal Blue Mountain)，铁毕卡亚种(varietal Typica)以及波邦亚种(varietal Bourbon)。牙买加蓝山是公认世界上最好的咖啡。铁毕卡咖啡原产于埃塞俄比亚及苏丹的东南部，是西半球栽培最广的咖啡变种，在夏威夷产量较高;夏威夷可那，是和蓝山咖啡不相上下的，在价格上也只有1~3美金的差距。波邦亚种是十八世纪由法国移民从波邦岛(Island of Bourbon，今天的法属留尼旺岛 Island of Reunion 位于马达加斯加岛东边的印度洋中)传入美洲，如今在巴西等西半球产地广泛种植，在中国云南有少量种植。波邦亚种的咖啡因含量比铁毕卡亚种高20%~30%，但是要少于绝大多数咖啡亚种。

　　主枝最初和主干呈45度向上生长，随果实负荷下垂，侧枝节部较密，结果多，产量较高。但浆果较小，成熟较快，因此不耐强风及大雨。波邦咖啡是小粒咖啡中仅次于铁毕卡的变种，结果多，产量较高，但浆果较小，成熟较慢; 中国云南种植的小粒咖啡主要是铁毕卡亚种和波邦亚种，从咖啡的植物学角度来讲，云南小粒咖啡和公认最优秀的牙买加蓝山(Jamaica Blue Mountain)、夏威夷可那(Kona)有基因上的相近性。

　　罗布斯塔种(学名Coffee Robusta Linden)。在非洲刚果发现的耐叶锈病品种，较阿拉比卡种有更强的抗病力。一般咖啡市场上，很多人都喜欢将罗布斯塔种和阿拉比卡种咖啡豆相提并论，这是不正确的。事实上罗布斯塔种原是刚果种(学名:Coffee Canephora)的突变品种，和阿拉比卡相提并论的应该是刚果种。然而时至今日，罗布斯塔种已为一般人常用，而不知其其实是刚果种的变异种类。

　　阿拉比卡种咖啡豆生长在热带地方较冷的高海拔地区，那不适合阿拉比卡种生长的高温低海拔地带，就是罗布斯塔种的天地了。罗布斯塔多种植在海拔200-600米的低地，喜欢温暖的气候，要求温度是24~29℃，对降雨量的要求并不高，但是，该品种要靠昆虫或风力传授花粉，所以，咖啡从授粉到结果要9—11个月时间，相对阿拉比卡种要长。

　　罗布斯塔种肯有独特的香味(被称为“罗布味”，有些人主为是霉臭味)与苦味，如果取2—3%的比例混合到其他咖啡里，那整杯咖啡都成了罗布味了(因此，罗布斯塔种咖啡豆是不可以作为单品咖啡豆饮用的)。它的风味是如些鲜明强烈，不过若想直接品尝它恐怕得先有心理准备。一般情况，罗布斯塔咖啡被用于即溶咖啡(其萃取出的咖啡液大约是阿拉比卡种的两倍)、罐装咖啡、液体咖啡等工业生产咖啡上。其咖啡因的含量远高于阿拉比卡种，大约为3.2%左右。

　　罗布斯塔种的咖啡树是一种介于灌木和高大乔木之间的树种，叶片较长，颜色亮绿，树最高可达10米，但树根却很浅，果实比阿拉比卡咖啡的果实略圆，也略小，豆身扁圆，中间坑纹直。 罗布斯塔种的产量占咖啡豆产量的25%—35%，其主要生产国在印尼(其出产的咖啡豆中有一个品种是一种水洗法加工的咖啡豆，是罗布斯塔种与阿拉比卡种的杂交品种，是中国市场上唯独一种可以用做单品饮用的咖啡豆)、越南、非洲、(以象牙海岸、奈及利亚、安哥拉为中心的西非诸国)、近年来越南更致力于咖啡生产，并将其列入国家政策中(越南也生产少部分的阿拉比卡咖啡豆)。