在水洗过程中，果实的果皮和果肉经特殊的去浆机处理与咖啡豆剥离。咖啡豆随后进入发酵缸进行发酵处理，以使粘膜不再粘滑。黏膜中的糖分会在发酵过程中被分解。根据发酵手法的不同，发酵的时间通常为12小时至6天（一些种植者会利用淋水系统发酵咖啡豆。这种方法被称为“肯尼亚水洗法（Kenyan method），通常会持续数日）。决定何时停止发酵极为重要。一旦咖啡过度发酵，咖啡的味道就会变得过酸。一旦粘膜的粘性物质被分解殆尽，人们就会利用大量的水将其冲洗下去（生豆处理过程中产生的废水被认为是咖啡工业的污染源头。如今，很多地区正在研究先进技术，以回收利用并过滤这一过程产生的废水）。水洗发产生于19世纪，也被称为“湿法加工”。

　　

　　严格受控的发酵过程会提高咖啡的酸度，并会在咖啡最终的口味中有所体现。但只要在发酵过程后立即进行水洗处理，咖啡的口味就可以得到提升，并带有明亮的酸味。

　　

　　我们知道，咖啡生豆处理方法大致可分为3种。区分每种方法的依据是在咖啡干燥之前，果实中有几层物质被去除。以下是三大处理方法一览表：

　　

　　1.自然日晒处理法：保留所有物质

　　

　　2.蜜处理法：去除果皮果肉，保留部分或所有粘膜（蜜）

　　

　　3.水洗法：利用水洗和发酵的方法去除果皮果肉及粘膜。这种方法也被称为“完全水洗法（Fully Washed）”。水洗发是世界上大部分咖啡原产国处理阿拉比卡咖啡豆最常见的方法。一些地区还会利用先进的高压水洗机来清洗咖啡豆的果皮果肉及粘膜，因此不再需要发酵处理。这种利用高压水洗机处理咖啡豆的方法被称为“自然水洗法（Pulped Natural）”。

　　

　　从咖啡处理时去除物质和用水量的多少来看，蜜处理法介于日晒法和水洗法之间