1808年拿破仑一世侵入西班牙的消息传到哥伦比亚后，该地人民立即掀起了独立运动。1810年7月20日，波哥大爆发了大规模反对西班牙殖民统治的暴动，逮捕了新格拉纳达总督。1811年11月，各地代表在波哥大组织国会，成立了新格拉纳达联合省政府，并于11月11日宣布独立。但是昆迪纳马卡没有承认这个联邦。在1812年底，在形成政体的争论最终导致内战。1814年又再一次爆发。1815年中，一支大规模的西班牙远征军抵达新格林纳达。推翻了联合省政府。16年五月，保皇党控制了整个新格林纳达。1815年西班牙殖民者卷土重来。1819年8月7日，S.玻利瓦尔领导起义军在博亚卡战役大败西班牙殖民军，10日攻克波哥大，从此结束了西班牙的殖民统治20世纪初，哥伦比亚经济有所发展，咖啡和石油产量增加,纺织业和食品业发展起来,交通运输也有所改进。1903年11月，美国策动巴拿马脱离哥伦比亚独立（见巴拿马独立）。与此同时，美国和英国大量投资于哥伦比亚的石油、铁路以及咖啡、香蕉种植园，大肆掠夺哥伦比亚的财富。1929年资本主义世界经济危机爆发后,哥伦比亚的咖啡和石油出口减少，人民生活更加困苦。1930年 7月，哥伦比亚共产党成立。同年，自由党人E.奥拉亚·埃雷拉当选总统（1930～1934在任）。

自由党再度执政后，在人民的压力下实行了一些改革。A.洛佩斯·普马雷霍第一次执政期间，于1936年修改宪法：明确三权分立原则,实行直接选举;废除天主教会对教育的垄断；规定工人有权罢工，有选择职业的自由；政府承认农民占领私人荒地的所有权，规定工人的最高工作日和失业补助。第二次世界大战期间，由于工业品进口减少,咖啡输出增多,哥伦比亚的工农业都有所发展,国家黄金储备增加,工人阶级队伍不断壮大。1941年12月太平洋战争爆发后，哥伦比亚与日本断交，1943年11月对德宣战