咖啡树开花二、三日之后即会凋谢，几个月后开始结出果实。咖啡花朵为白色，和茉莉花很像，果实为核果，直约1.5厘米，最初呈绿色，后渐渐变黄，成熟后转为红色，和樱桃非常相似，因此称为樱桃咖啡(Coffee Cherry)，此时即可采收。

咖啡果实内含有两颗种子，也就是咖啡豆。事实上在不同国家及不同地区，咖啡豆采收时间都不相同。采收过程需要大量的人力，特别是高质量特选的咖啡，只能采摘完全成熟的红色樱桃咖啡。因为所有的樱桃咖啡不是在同一时间成熟，所以需要多次回到同一棵树去采摘。

一般而言，咖啡豆加工可分二种方式：水洗式和干燥式。

水洗式wet method

先将咖啡樱桃外层的果肉除去，然后浸泡在一个很大的盛满水的水泥槽内。经过发酵处理之后，水洗式咖啡会有一种特有的鲜明清澈的风味。发酵过后的咖啡豆再以清水洗过，然后排除水份再放在阳光下晒干或是用机器干燥之。最后用脱壳机将肉果皮和银皮除去，即可进行筛选并分成不同等级的生咖啡豆。

干燥式dry method

处理方法是将咖啡樱桃广布在曝晒场上两个星期，每天用耙扫过几次，使咖啡豆可以干的比较均匀。当晒干之后，咖啡豆会与外皮分开，以脱壳机将干掉了的果肉，肉果皮去除，然后经过筛选并分成不同的等级。

无论是水洗咖啡，还是干燥式地加工咖啡，都能生产出优质的咖啡。