1808年拿破仑一世侵入西班牙的消息传到哥伦比亚后，该地人民立即掀起了独立运动。1810年7月20日，波哥大爆发了大规模反对西班牙殖民统治的暴动，逮捕了新格拉纳达总督。1811年11月，各地代表在波哥大组织国会，成立了新格拉纳达联合省政府，并于11月11日宣布独立。但是昆迪纳马卡没有承认这个联邦。在1812年底，在形成政体的争论最终导致内战。1814年又再一次爆发。1815年中，一支大规模的西班牙远征军抵达新格林纳达。推翻了联合省政府。16年五月，保皇党控制了整个新格林纳达。1815年西班牙殖民者卷土重来。1819年8月7日，S.玻利瓦尔领导起义军在博亚卡战役大败西班牙殖民军，10日攻克波哥大，从此结束了西班牙的殖民统治1823年，玻利瓦尔应秘鲁爱国者的请求，经国会批准，率哥伦比亚军队进入秘鲁同西班牙西班牙殖民军作战。

1824年，哥伦比亚与秘鲁联军打败西班牙殖民军，秘鲁获得了独立。玻利瓦尔率军在秘鲁作战期间，桑坦德尔代行总统职务，主持哥伦比亚政务。桑坦德尔主张建立联邦制的政权，并联合地方势力反对玻利瓦尔团结统一的政治主张。哥伦比亚国会和政府内部的派别斗争日益尖锐。

1826年 4月，以派斯为首的委内瑞拉地方执政者及反对以桑坦德尔为首的新格拉纳达执政者，要求单独成立国家。经玻利瓦尔调解，分裂活动暂时被制止，但内部矛盾和派别斗争依然存在。

1828年5月8日哥伦比亚国民代表会议在奥卡尼亚召开。以玻利瓦尔为首的中央集权派同以桑坦德尔为代表的联邦派在会议上发生尖锐冲突。之后，各地方的分裂倾向愈益明显。

1829年11月，委内瑞拉发表声明，退出大哥伦比亚共和国。

1830年1月，玻利瓦尔在国会辞去总统职务，以期消除分歧，维护国家统一，但无济于事。5月31日，基多地区宣布退出哥伦比亚，成立厄瓜多尔共和国。12月17日，玻利瓦尔逝世，随后，哥伦比亚解体。1831年哥伦比亚及巴拿马地区改名为新格拉纳达共和国

其一：据说是从加勒比海的海地岛，经中美洲的萨尔瓦多从水路传来的。

其二：1808年,一名牧师从法属安的列斯经委内瑞拉将咖啡豆首次引入哥伦比亚。其中一种是哥伦比亚的第一批咖啡种子是通过圣坦德省由委内瑞拉入境的。[1] 

其三：关于哥伦比亚咖啡种植的最早记录出现于西班牙传教士Jose Gumilla的名为“The Illustrated Orinoca”的书中。他描写了他于1730年在Meta河两岸传教时的见闻，其中提到了当地的咖啡种植园。到了1787年的时候，其他的传教士已经把咖啡传播到了哥伦比亚境内的其他地方哥伦比亚咖啡的品种主要为小粒咖啡。植物为小乔木或大灌木，高5-8米，基部通常多分枝；老枝灰白色，节膨大，幼枝无毛，压扁形。叶薄革质，卵状披针形或披针形，长6-14厘米，宽3.5-5厘米，顶端长渐尖，渐尖部分长10-15毫米，基部楔形或微钝，罕有圆形，全缘或呈浅波形，两面无毛，下面脉腋内有或无小窝孔；中脉在叶片两面均凸起，侧脉每边7-13条；叶柄长8-15毫米；托叶阔三角形，生于幼枝上部的顶端锥状长尖或芒尖，生于老枝上的顶端常为突尖，长3-6毫米。聚伞花序数个簇生于叶腋内，每个花序有花2-5朵，无总花梗或具极短总花梗；花芳香，有长0.5-1毫米的花梗；苞片基部多少合生哥伦比亚咖啡纯正的味道，来自于哥伦比亚那具有咖啡生长最有利条件的自然环境。但除此之外，与当地的种植者辛勤的努力是分不开的。在哥伦比亚，咖啡的种植面积达到了107万公顷，全国约有30.2万个咖啡园，30%到40%的农村人口的生活都直接依靠咖啡生产。哥伦比亚虽然有不少农场，但面积都不大。每个农场的面积只有2公顷左右，80%以上的咖啡种植园的咖啡树只有5000棵左右，平均3000棵。由此可见，哥伦比亚的农业属小农庄型。当地人在咖啡树周围种上高大的乔木或香蕉树。幼苗期为咖啡树搭凉棚，以保证咖啡生长所需要的阴凉潮湿环境。由于咖啡林内湿度大，温差小，咖啡豆成熟慢，有利于咖啡碱和芳香物质的积累，因而咖啡质量最好