原生种
在所有咖啡的产量中，阿拉比卡种咖啡占据了70%-80%，它绝佳的风味和香气使其成为所有咖啡原生种中唯
阿拉比卡豆
阿拉比卡豆 (8张)
一能够直接饮用的咖啡。但是它对于干燥、霜害、病虫害等的抵抗力过低，特别不耐咖啡的天敌--叶锈病，因而各产地国都在致力于品种的改良。
原来世界上的商品咖啡都是小粒咖啡，只是到了19世纪末因为叶锈病的肆虐导致大量咖啡庄园的倒闭，种植者才开始寻找其他抗病的品种。
小粒咖啡仍然是最主要的咖啡品种，约占世界咖啡总产量的3/4。主要在拉丁美洲各国种植，也有部分在印度尼西亚和太平洋岛屿种植。世界最大的咖啡产地巴西的地理气候条件非常适合小粒咖啡的生长，种植的主要咖啡品种也是小粒咖啡，巴西的咖啡产量占世界总产量的1/3以上。
小粒咖啡的果实比中粒咖啡和大粒咖啡要小，浆果椭圆型，一般内有两粒种子，即所谓的“咖啡豆”。
亚种
小粒种咖啡阿拉比卡种（Coffea arabica）系列中三个出现较早的亚种是：蓝山亚种（varietal Blue
咖啡花
咖啡花
Mountain），铁比卡亚种（varietal Typica）以及波旁种（varietal Bourbon）。
牙买加蓝山是品质极佳的咖啡；铁毕卡咖啡原产于埃塞俄比亚及苏丹的东南部，是西半球栽培最广的咖啡变种；在夏威夷产量较高的夏威夷可那（Kona）和蓝山咖啡在质量上不相上下，在价格上也只有1~3美金的差距。
波旁种是十八世纪由法国移民从波邦岛（Island of Bourbon，今天的法属留尼旺岛Island of Reunion，位于马达加斯加岛东边的印度洋中）传入美洲，如今在巴西等西半球产地广泛种植，在中国云南也有少量种植。波邦亚种的咖啡因含量比铁毕卡亚种高20%~30%，但是要少于绝大多数咖啡亚种。主枝最初和主干呈45度向上生长，随果实负荷下垂。侧枝节部较密、结
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果多、产量较高，但浆果较小，成熟较快，因此不耐强风及大雨。波邦咖啡是小粒咖啡中仅次于铁毕卡的变种，结果多，产量较高，但浆果较小，成熟较慢。中国云南种植的小粒咖啡主要是铁毕卡亚种和波邦亚种，从咖啡的植物学角度来讲，云南小粒咖啡和公认最优秀的牙买加蓝山(Jamaica Blue Mountain)、夏威夷可那(Kona)有基因上的相近性
