小粒种咖啡阿拉比卡种(Coffea arabica)系列中三个出现较早的亚种是∶蓝山亚种(varietal Blue Mountain),铁毕卡亚种(varietal Typica)以及波邦亚种(varietal Bourbon)。牙买加蓝山是公认世界上最好的咖啡。铁毕卡咖啡原产于埃塞俄比亚及苏丹的东南部,是西半球栽培最广的咖啡变种,在夏威夷产量较高;夏威夷可那,是和蓝山咖啡不相上下的,在价格上也只有1~3美金的差距。波邦亚种是十八世纪由法国移民从波邦岛(Island of Bourbon,今天的法属留尼旺岛 Island of Reunion 位于马达加斯加岛东边的印度洋中)传入美洲,如今在巴西等西半球产地广泛种植,在中国云南有少量种植。波邦亚种的咖啡因含量比铁毕卡亚种高20%~30%,但是要少于绝大多数咖啡亚种。主枝最初和主干呈45度向上生长,随果实负荷下垂,侧枝节部较密,结果多,产量较高。但浆果较小,成熟较快,因此不耐强风及大雨。波邦咖啡是小粒咖啡中仅次于铁毕卡的变种,结果多,产量较高,但浆果较小,成熟较慢;
中国云南种植的小粒咖啡主要是铁毕卡亚种和波邦亚种,从咖啡的植物学角度来讲,云南小粒咖啡和公认最优秀的牙买加蓝山(Jamaica Blue Mountain)、夏威夷可那(Kona)有基因上的相近性原来世界上的商品咖啡都是小粒咖啡,只是到了19世纪末,发生了一次大面积的病害,种植者才开始寻找其他抗病的品种,目前小粒咖啡仍然是最主要的咖啡品种,约占世界咖啡总产量的3/4。主要在拉丁美洲各国种植,也有部分在印度尼西亚和 太平洋 岛屿种植。目前世界最大的咖啡产地巴西的地理气候条件非常适合小果咖啡的生长,种植的主要咖啡品种也是小粒咖啡,巴西的咖啡产量占世界总产量的1/3以上。