影响咖啡风味的最重要一步，就在于烘焙方法。
影响烘焙的因素有很多，例如气候、湿度、生豆的软硬度及含水量。由于变量很多，烘焙的经验，就是最重要的关键
咖啡生豆在未烘焙前，有一股土腥味，在经过烘焙后，就会散发出浓郁的香气。而咖啡豆的烘焙度(roasting degree)深浅，亦会影响咖啡风味和咖啡因含量。烘焙愈浅，果酸味愈浓，咖啡因含量愈高。烘焙愈深，酸味愈淡，甘苦味会愈明显，咖啡因含量愈低。
烘焙过程：
生豆经过摄氏二百度以上的烘焙，水分开始蒸发，体积会膨胀、重量则会减轻，烘焙愈深，重量损失愈多。
另一个现象是烘焙过程中，咖啡豆会释放出二氧化碳，经烘焙后的熟豆仍会在三十天内继续排气，这样有助于咖啡豆保持新鲜，这是因为在排出二氧化碳时，氧分子不易入侵而破坏咖啡的风味，咖啡豆便不会氧化。若咖啡豆氧化了，风味就会很快变差，所以，用新鲜咖啡豆冲泡出来的咖啡风味特别佳。
烘焙秘诀：
秘诀一：取得最高焦糖化 - 焦糖化是影响咖啡风味重要因素，由于生豆烘焙时会吸收大量热能，这时便出现第一次爆烈声 (1st cracking)，此时，糖分开始转化为二氧化碳、水分继续蒸发，咖啡的芳香会逐渐散发出来，并形成咖啡油脂。此热解反应可持续到第二爆 (2nd cracking)，但在第二爆完成时，应立刻，并尽快以冷风降低豆子的温度，这样便可获得最高的焦糖化。
秘诀二：最少的碳化 -在烘焙过程中，有些成分也会被碳化掉，形成出不好的苦涩物质，所以，在完成第二爆时，停止加热便可同时把碳化减到最低了。
秘诀三：注意声音的变化- 咖啡豆在烘焙过程会发出两次爆裂声响，第一爆的声音较低沈，表示开始淀粉开始转化成焦糖，水分也随着二氧化碳而蒸发。第二爆裂声较猛烈尖锐，这是咖啡豆细胞纤维断裂的声响，此时就应立刻停止加热，并尽快以冷风降低豆的温度。第一爆和第二爆的时间，可以相差很多，所以烘焙不同的豆，都要找出最适合此豆的烘焙条件。
秘诀四：注意颜色和味道的变化 - 咖啡豆颜色会随着持续加温，由绿色转成浅褐色，再而呈微量出油的赤褐色，接着大量出油呈发亮的黑褐色。此时，就不可以再烘下去了，否则豆子表面的咖啡油会变干，并会冒出大量烟及焦味。
总括来说， 咖啡烘焙是一门学问，生豆的年分、密度、硬度和含水度都会左右烘焙后的咖啡质量；就连烘焙当天的相对湿度、温度，都不可忽视
刚刚烘焙后的咖啡豆，最好放上2-5天，让咖啡豆里面二氧化碳大量排出后再饮会更顺口,香港咖啡会选用的单向透气阀的铝箔袋保存咖啡豆，可防止空气进入造成氧化，又能让二氧化碳排出，确保咖啡豆保持于新鲜的最佳状况。
