肯尼亚种植的是Bourbon波旁，20世纪五十年代，当时的农业研究机构斯科特实验室(Scott Laboratory)经过不懈努力，选育了SL-28、SL-34两个优秀杂交种，颠覆了长久以来人工选育品种没有天然品种优秀的偏见。SL-28、SL-34帮助肯尼亚咖啡形成了自己独一无二的风味特质，在咖啡界树立起完美的口碑。

　　跟其他咖啡生产国政府的选择一样，虽然SL-28、SL-34经受住了时间的考验，为肯尼亚咖啡培养一代又一代的忠实拥泵，出于咖啡产量和抗病性的考量，肯尼亚政府及咖啡研究所(Coffee Research Foundation)开始努力推广一个新品种Ruiri 11，推广者向咖啡爱好者们保证新品种仍然拥有肯尼亚咖啡的精典风味，可是持续的努力并没有换来咖啡饕客们的认可，老饕们一致认为新品种口味欠奉，Ruiru11的前景仍待观察。
　大型农场通常拥有独立的处理设施。数量众多的小型农户，通常自行手工采摘成熟的咖啡果。咖啡采摘是劳动密集型的工作，在收获季需要全家出动甚至还得雇用工人。采摘的咖啡鲜果需要及时运送到合作社拥有的咖啡处理工厂进行脱皮(pulping)，运输工具可能是牛车、皮卡或者货车。脱皮之后，带壳豆(Parchment coffee)在合作社的处理厂短暂保管之后，被送到私人拥有的工厂进行脱壳处理咖啡拍卖制度虽然有效的提高了高品质咖啡的售价，但也不是没有弊端，一是众多贸易中间商的存在侵蚀了咖啡农的利益，拍卖所得的高价不能完全反馈给辛苦工作的咖啡农，二是拍卖的咖啡很难确切追溯生产信息，对于日渐兴盛的精品咖啡市场，可追溯性是咖啡生豆评价的重要标准。基于上述因素，肯尼亚政府已经开始放松对咖啡直接贸易的限制，得到国家认证的代理商可以直接将咖啡豆销售给国外的精品咖啡烘焙商等客户，直接贸易可以令生产高品质咖啡的农户得到更多的奖励