波邦亚种是十八世纪由法国移民从波邦岛(Island of Bourbon,今天的法属留尼旺岛Island of Reunion,位于马达加斯加岛东边的印度洋中)传入美洲,如今在巴西等西半球产地广泛种植,在中国云南也有少量种植。波邦亚种的咖啡因含量比铁毕卡亚种高20%~30%,但是要少于绝大多数咖啡亚种。主枝最初和主干呈45度向上生长,随果实负荷下垂。侧枝节部较密、结果多、产量较高,但浆果较小,成熟较快,因此不耐强风及大雨。波邦咖啡是小粒咖啡中仅次于铁毕卡的变种,结果多,产量较高,但浆果较小,成熟较慢。中国云南种植的小粒咖啡主要是铁毕卡亚种和波邦亚种,从咖啡的植物学角度来讲,云南小粒咖啡和公认最优秀的牙买加蓝山(Jamaica Blue Mountain)、夏威夷可那(Kona)有基因上的相近性